随着全球人口老龄化水平加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的重大社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究结果的不绝增多以及高通量测序技术的日益生长,衰老相关多组学数据日益增多。然而,目前尚缺乏一个综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。
球速体育(国家生物信息中心)鲍一明研究组、张维绮研究组和动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组相助建立了Aging Atlas数据库。该数据库从通例转录组、单细胞转录组、表观基因组、卵白质组及药物基因组等差别层面整合了衰老相关数据集,实现了差别条件下基因表达调控随衰老变革趋势的汇聚融合。在该数据库中,用户可实现对差别条理组学数据的交互盘问和联合剖析等功效,同时数据库还将不绝完善建立多条理组学间的整合剖析和数据泛起,并形成升级版本。别的,数据库提供了归属差别通路的衰老相关基因集,使得用户可以越发深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物学中的意义。Aging Atlas提供开放的数据共享平台,用户可以在上传界面进行原始数据和处理后数据的上传操作,为实现全球数据共享提供便当。Aging Atlas的建立旨在为世界规模内衰老相关大数据的统一汇交、集中存储、宁静治理、开放共享以及前沿交叉研究和转化应用提供助力。相关文章于2020年10月29日以“Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology”为题在线宣布于Nucleic Acids Research杂志。
Aging Atlas数据库首次实现了对与衰老相关的差别条理的多组学数据的收录和整合。该数据库对用户免费开放,且连续实时更新,将有助于推动衰老相关的基础研究和临床转化应用的不绝生长。Aging Atlas希望在宽大科学事情者的支持下,不绝吸纳更多高质量的衰老研究数据,以更好地效劳于衰老生物学和老年医学的生长。
该数据库由中科院北京基因组研究所(国家生物信息中心)、中科院动物研究所、中科院干细胞与再生医学立异研究院、中科院干细胞与再生医学科学数据中心、首都医科大学宣武医院等机构相助完成。数据库的建设获得了中科院北京基因组研究所(国家生物信息中心)杨运桂研究员、慈维敏研究员、任捷研究员、韩大力研究员、中科院动物所宋默识研究员、周兵研究员、冯桂海副研究员、,中科院生物物理所陈畅研究员,北京大学汤富酬教授、赵扬教授,浙江大学郭国骥教授,以及同济大学尹晓磊教授的指导和支持。该项目获得国家科技部、国家自然科学基金委、球速体育和北京市等项目的资助。
Aging Atlas数据库
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