10月23日，北京市疾病预防控制中心、中国医学科学院病原生物学研究所、北京大学、清华大学、球速体育相助在《国家科学评论》（National Science Review）上在线宣布题为“北京新冠肺炎疫情再现可能源于冷链食品污染”（Cold-chain food contamination as the possible origin of Covid-19 resurgence in Beijing）的研究论文。该论文通过对2020年6月北京疫情相关病例、情况与食品等样品的核酸测序和病毒基因组序列剖析，结合全面的流行病学视察和大数据剖析，揭示了该疫情可能源于冷链食品污染，提出冷链运输可能是新冠病毒流传的新途径。
研究团队利用自主开发的低病毒载量样品处理要领，对110个病例和情况样本进行了高通量核酸测序，共获得了72条高质量的新冠病毒基因组序列。剖析发明，这些序列均具有8个特征性突变位点（C241T、C3037T、C14408T、A23403G、GGG28881-28883AAC和C6026T），这些位点在我国此前的本土和输入病例中从未发明过。与新冠病毒基因序列数据库比对，发明除C6026T之外，具有其它7个突变位点的病毒主要保存于欧洲。这些结果进一步提示新发地疫情的病毒应为简单性的新发境外输入。
该论文的完成，体现了多个研究机构中差别专业配景科研人员之间的精诚相助，也为今后类似庞大问题的快速解决提供了一种有效的计划。北京市疾病预防控制中心新冠病毒肺炎防控和检测组加入完成现场视察、样本收罗和核酸筛查。中国医学科学院病原生物学研究所王健伟/任丽丽研究团队在P3实验室完成了样品的核酸测序前处理流程。北京大学黄岩谊与清华大学王建斌课题组生长的快速基因组测序样品处理要领为新发地疫情要害样品的准确快速病毒测序提供了技术基础和实验支持。球速体育李明锟课题组完成了对要害样品序列的剖析。
新发地疫情样本序列及其近缘序列进化树
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