m5C修饰是mRNA上漫衍广泛的碱基修饰形式之一,但关于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。
中科院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生化细胞所黄旲团队相助研究,发明m5C通过细胞质内新结合卵白YBX1调控mRNA的稳定性,进而调控膀胱癌的增殖和转移。相关研究结果在7月29日以5-methylcytosine promotes pathogenesis of the bladder cancer through stabilizing mRNAs为题在线宣布于Nature Cell Biology杂志。
研究团队首先绘制了膀胱癌组织中mRNA上的m5C单位点图谱,发明癌症通路相关基因的mRNA倾向于高甲基化修饰,随着膀胱癌分级、淋投合转移的疾病进展,相关原癌基因mRNA m5C甲基化水平逐渐升高。利用Oligo-pull down结合质谱、卵白解构技术和高通量测序技术发明了细胞质内新的m5C结合卵白YBX1,W65是YBX1识别mRNA m5C的要害氨基酸,并且YBX1以m5C依赖的方法调控mRNA稳定卵白ELAVL1的RNA结合能力。相比于癌旁组织,m5C甲基转移酶NSUN2和m5C结合卵白YBX1在膀胱癌组织中高表达。进一步通过体内、体外小鼠成瘤和转移实验及高通量测序技术,证明了NSUN2和YBX1以m5C依赖的方法增进HDGF mRNA的稳定性并最终增进膀胱癌肿瘤的增殖和转移。
该研究揭示了mRNA甲基化调控实体瘤膀胱癌爆发的分子机制,为膀胱癌预防和治疗提供了新的研究偏向;在新的层面上揭示了mRNA 甲基化修饰作为新的调控手段调控肿瘤的爆发,这种转录后修饰可能在其它肿瘤疾病中也发挥着重要作用。该研究获得了国家重点研发计划、国家自然科学以及球速体育战略性先导科技专项等基金资助。
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NSUN2/YBX1通过m5C介导调控HDGF mRNA稳定性增进膀胱癌的爆发