北京基因组所开发泌尿生殖系统肿瘤诊断和预后的液体活检技术
泌尿生殖系统（genitourinary, GU）肿瘤是指爆发在泌尿生殖系统上的肿瘤 ，包括肾癌 ，尿路上皮癌 ，前列腺癌等。到2020年 ，全世界GU癌症的预计发病率将凌驾200万 ，死亡人数约80万人。目前对GU肿瘤的诊断和监测要领多为侵袭性或缺乏敏感性和特异性。液体活检技术凭借其无创或微创、实时监控等优势已然成为肿瘤研究领域的新兴技术。
近日 ，中科院北京基因组研究所慈维敏组与北京大学第一医院、北京大学第三医院以及北京大学航天中心医院相助开发了泌尿生殖系统肿瘤诊断和预后的液体活检技术 ，该项研究结果以“Non-invasive Detection and Localization of Genitourinary Cancers Using Urinary Sediment DNA Methylomes and Copy Number Profiles”为题在学术期刊《欧洲泌尿学杂志》（European Urology）在线宣布。
基于尿沉渣DNA的GU肿瘤诊断和定位 ，研究团队开发了GUseek技术。该技术通过对225例GU肿瘤患者（60例前列腺癌 ，100例尿路上皮癌 ，65名肾癌患者）和88名健康人群的尿沉渣DNA进行低深度全基因组重亚硫酸氢盐测序 ，获得了每个样本的DNA甲基化和拷贝数变异信息�；诟眯畔⒐菇ǖ亩掷嗥� ，能够准确地从健康个体中检测出GU肿瘤（尿路上皮癌AUC=0.972 ，前列腺癌AUC=0.940 ，肾癌AUC=0.962）。最终 ，团队建立了集身分类系统GUseek。经比较 ，该系统优于其他6种广泛使用的机械学习算法 ，对非肿瘤组、尿路上皮癌组、前列腺癌组和肾癌组的总体准确率抵达90.57%。别的 ，结合TCGA的临床数据 ，研究团队建立了一个有效预测尿路上皮癌和肾癌患者的预后危害评估模型。
该研究首次证明尿沉渣DNA甲基化和CNA联合剖析在GU肿瘤早期诊断、复发监控、治疗评估等潜在临床应用方面的可行性 ，并为其在GU肿瘤患者预后生存评估的应用提供了一个看法性证明。
该研究获得了球速体育战略性先导科技专项、国家自然科学以及国家重点研发计划等基金资助。
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基于尿沉渣DNA甲基化和拷贝数信息对泌尿生殖系统肿瘤进行检测 ，定位和预后评估的液体活检技术示意图
